由于水源热泵技术利用地表水作为空调机组的制冷制热的源，所以具有以下优点:
属可再生能源利用技术。水源热泵是利用了地球水体所储藏的太阳能资源作为冷热源，进行能量转换的供暖空调系统。其中可以利用的水体包括地下水或河流、地表的部分河流、湖泊和海洋。地表土壤和水体不仅是一个巨大的太阳能集热器，收集了47%的天阳辐射能量，比人类每年利用能量的500倍还多(地下的水体是通过土壤间接地接受太阳辐射能量)，而且是一个巨大的动态能量平衡系统，地表的土壤和水体自然地保持能量接收和发散的相对均衡。这使得利用储存于其中的近乎无限的太阳能或地能成为可能。所以说，水源热泵利用的是清洁可再生的能源。
高效节能。水源热泵机组可利用的水体温度冬季为121℃~221℃，水体温度比环境空气温度高，所以热泵循环的蒸发温度提高，能效比也提高。而夏季水体为18℃~35℃,水体温度比环境空气温度低，所以制冷的冷凝温度降低，使得冷却效果好于风冷式和冷却塔式，机组效率提高。据美国环保署EPA估计，设计安装良好的水源热泵，平均来说可以节约用户30%~40%的供热制冷空调的运行费用。
运行稳定可靠。水体的温度一年四季相对稳定，其波动的范围远远小于空气的变动， 是很好的热泵热源和空调冷源，水体温度较恒定的特性使得热泵机组运行更可靠、稳定，也保证了系统的高效性和经济性，不存在空气源热泵的冬季除霜等难点问题。
