机组经过手动运行调试、自动元件和设备的试验后，可进行自动调试。操作步骤为:开冷却水泵，压力稳定后开冷媒水泵，再开冷却塔风机。将电控板上的操作钮子从“手动”拨到“自动”位置。按“运行”按钮，机组按电控程序自动开启溶液泵、发生泵、冷剂水泵、供蒸气的执行机构和蒸气调节阀，实行自动供高压蒸气，机组投入运行。各泵之间开启时间过早或过晚，用调整时间继电器的方法解决。
机组手动和自动运行调试后，还要对冷水机组的制冷量进行核算。一般要求在冷媒水出口管道上安装流量计，冷水机组工况稳定后才能进行测量。制冷量的核算，是根据测量的单位时间内冷媒水的流量读数和冷媒水的进、出水温差来计算的。其计算公式为:
Q=G/T·C·∆t
式中，Q为机组的制冷量，单位为kW; G为测量时间内所流经的冷媒水质量，单位为kg;T为测量所用的时间，单位为S; C为水的比热，单位为kJ/kg℃ ; ∆t为冷媒水进、出机组的温差，单位为℃。
若通过检查算得的制冷量小于机组规定的出率，要分析原因，进行排除。若难以消除而达不到设计要求，要与生产厂家联系协商解决。若调试合格、制冷量达到要求，此项工程可交付单位使用。
