蒸发式冷凝器的控制特点是:可以根据冷凝压力确定冷凝风扇的开启数量以及水泵的运行数量;在北方地区冬季对于没有设置油泵的螺杆压缩机设置恒压起动，以及冷凝风扇的变频运行。
对于一些控制回路，控制要求并不是太多，局部也有使用继电器控制的。而对于自带控制面板的设备，例如自动放空气器，直接给这些设备提供电源即可。
对于一些制冷系统不是很大，系统控制比较简单的，可以直接使用固定控制线路的控制模块(例如小精灵的控制模块)，在使用这些模块时可以根据使用的需要，简单地编制输入一些应用的数据。例如需要控制的各个冷间的温度，冷风机融霜的时间，融霜的结束温度，甚至是融霜结束后冷风机风扇的延时开始时间等。
一些更加先进的设计已经采用以太网，对制冷系统进行控制和数据采染与传送，网络控制将是今后控制的发展方向。这种控制方式可以通过网络远程对系统的控制程序进行修改和侧试，在这些网络监控中，用户和设计安装单位根据不同的岗位有不同级别的使用密码，不同等级的使用密码可以进入这个系统不同的控制层面，最高级别的密码可以对整个控制系统任意进行修改。为了防止随意对系统的修改造成系统的控制程序紊乱，以防止网络黑客的入侵，这种系统的设置除了严格控制对密码的管理外，还要设置严密的网络安全保护措施，防止对系统的破坏和商业勒索事件的发生。
