虽然冷冻库和冷库都属于冷库范畴，但是，由于两者在使用性能及设计规范上差别较大，因此，在实际使用过程中，要严格按照库房的设计用途来使用，不得互换使用。否则，不仅会造成冷库资源的极大浪费。还有可能给储存物品造成损害。如果确有需要对冷库的使用用途进行改变时，必须按照新的用途的要求，对库房的制冷能力、保温材料、设施设备类型及结构进行全面改造，以满足新的用途的需要。
冷冻、冷藏物品入库作业前，除了按照普通仓库入库作业所进行的点验、检查、抽查等作业之外，还要对送达货物的温度及冷冻、冷藏状况进行测定，同时查验物品的内部状态，并进行详细的记录；对于已霉变或已腐败的物品，不得接收人库；物品入库前要进行预冷处理。以保证物品或物品单元的温度能够均匀地下降到规定的溢度;未经预冷冻结的物品，不得直接进入冷冻库，以免高温物品大量吸冷，造成库内温度升高而影响库内其他冷冻物品。
冷冻、冷藏物品搬运作业时要使装运车辆尽量靠近库门，以缩短物品露天搬运的距离，防止隔车搬运。应采用推车、叉车、输送带等机械进行搬运，同时尽量采取托盘等单元化作业，以加快搬运作业速度。搬运中不得将物品散放在地坪，以避免物品、托盘等冲击地坪、内墙、冷管等。作业中的起吊机具所起吊的重量，不得超过机具本身所设计的负荷标准。
