冷却塔中的集水盘(槽)中的污垢或微生物积存可以采用刷洗的方法予以清除。在清洗冷却塔中的集水盘(槽)时要注意的是，清洗前要堵住冷却塔的出水口，清洗时打开排水阀，让清洗的脏水从排水口排出，避免清洗时的脏水进入冷却水回水管。此种操作方法在清洗布水装置、配水槽、填料时都可以使用。
此外，可以在集水盘(槽)的出水口处加设一个过滤网用以挡住大块杂物（如树叶、纸屑、填料碎片等)随水流进入冷却水回水管道系统。
由于冷却塔的吸声垫是采用疏松纤维型材料，在冷却塔工作过程中长期浸泡在集水盘中，很容易附着污物，所以吸声垫清洗时可以用清洁剂配以高压水进行冲洗。
