在水系统调试完毕以后，下一步可进行主机组的调试。调试时，可根据天气情况，选择制冷或供暖功能，操纵功能键，进行主机组的运行调试。
通电以后，待水系统运行15min后，主机自动起动运行，要观察风扇电动机风扇扇叶的转向是否正确，听机组运行声音是否正常，如有异常，应立即停机。进行检查，排除故障后，再重新机组运行。
(1)机组运行正常时，压缩机的工作参数应在下述范围。
1)制冷工况。低压压力0.35~0. 55MPa，排气压力1.30~2.20MPa。
2)制热工况。低压压力0. 18~0.42MPa，排气压力1.60~2.20MPa。
3)机组的冷媒水进出水温差应在4~5℃为宜。
(2)机组起停调试。在机组进行制冷工况运行时，将风机盘管全部关闭，使系统的回水温度低于12℃,压缩机应能自动停机;然后将风机盘管全部打开，使系统的回水温度高于12℃,压缩机应能自动起动。
在机组进行制热工况运行时，将风机盘管全部关闭，使系统的回水温度高于40℃，压缩机应能自动停机;然后将风机盘管全部打开，使系统的回水温度低于40℃，压缩机应能自动起动。
(3)机组除霜调试。在机组进行制热工况运行一段时间后，当室外的冷凝器表面温度达到-3℃时，机组应进行除霜运行。此时，室外的风扇电动机应停止转动，电磁阀恢复制冷运行工况。而机组的压缩机和水系统仍在运行，大约过10min以后，室外的冷凝器表面温度达到15℃时，除霜过程结束，机组恢复制热工况运行。
主机组调试运行一般要进行4h左右，待各项参数合格后，停止机组运行。将测试仪表拆除，并再检查一下机组的电路系统的接线情况和系统的阀门开启情况，若没问题即可交付使用。
