由于气调库的建筑、设备的特殊性，气调库的安全管理也是十分重要的工作。
(1)库房围护结构的安全管理气调库是一种对气密性有特殊要求的建筑物，库内外温度的变化，以及在气调设备的运行中，都可能引起库房围护结构两侧压差变化。压差值超过一定限度，就会破坏围护结构，这点不可因气调库设置了安全阀和调气袋就可以掉以轻心。
(2)人身安全管理要求气调库的操作、管理人员，一定要掌握安全知识:气调库内气体不能维持人的生命，不可像出入冷藏库那样贸然进入气调库;必须熟练掌握呼吸装置的使用。
为了更好地保证人身安全，必须制订下列管理措施，以防止发生人身伤亡事故:
1)在每扇气调库的气密门上，书写醒目的危险标志:“危险—库内缺氧，未戴氧气罩者严禁入内”。封库后，气密门及其小门应加锁，防止闲杂人员误入。
2)需进入气调库维修设备或检查贮藏质量时，需两人同行，均戴好呼吸装置后，一人入库，一人在观察窗外观察，严禁两人同时入库作业。
3)至少要准备两套完好的呼吸装置，并定期检查其可靠性。
4)开展经常性的安全教育，使所有的操作管理人员树立强烈的安全意识。
