机组程序重故障时将导致故障停机。故障停机有两种程序:一种是机组不进行稀释运转而直接停机，同时发出声光报警信号，相关的故障指示灯亮;另一种是机组稀释运行后再停机，同时发出故障报警，相关的故障指示灯亮。
1、蒸汽型机组。故障发生后，不进行稀释直接停机的故障包括冷媒水断水或冷媒水量不足、屏蔽泵故障及冷剂水低温等。故障发生后，进行稀释运行的故障包括蒸汽压力过高、高压发生器液位过高或过低及高压发生器温度过高等。溴化锂蒸汽型机组程序故障停机系统流程图如图5-31所示。
2、直燃型机组。故障发生后，不进行稀释的故障包括冷媒水断水或冷媒水量不足、屏蔽泵故障及冷剂水温过低等。故障发生后，进行稀释运行的故障包括燃烧器熄火、高压发生器液位过高或过低、高压发生器溶液高温、高压及排气温度过高等。溴化锂直燃型机组程序故障停机系统流程图如图5-32所示。
