1、停机后低温制冷剂的处理 当复叠式制冷机在停止运转后，系统内部温度会逐渐升高到接近环境温度，低温部分的制冷剂就会全部汽化成过热蒸气，这时低温部分的压力将会超出制冷系统允许的最高工作压力这一非常危险的情况。当环境温度为40℃时，低温部分允许的最高绝对压力为1. 079MPa。为解决这一问题，大型系统采用高温系统定时开机，以维持低温系统较低压力，但这种方法耗功大，或者将低温制冷剂抽出装入高压钢瓶中。对于小型复叠式制冷装置，通常在低温部分的系统中连接一个膨胀容器，当停机后低温部分的制冷剂蒸气可进入膨胀容器，如系统中不设膨胀容器，则应考虑加大蒸发冷凝器的容积，使其起到膨胀容器的作用，以免系统压力过高。
2、系统的启动 由于低温制冷剂的临界温度一般较低，所以复叠式制冷机在启动时，必须先启动高温部分，当高温部分的蒸发温度降到足以保证低温部分的冷凝压力不超过允许的最高压力时，才可以启动低温部分，例如:对于使用R22与R13的二元复叠式制冷循环，要先将R22的蒸发温度降至-15℃以下，这时低温系统中R13的最高冷凝温度大约为-10℃，相应的饱和压力为1. 5616 MPa(在允许值内)，对于小型复叠式制冷循环，高低温部分可同时启动，但在低温系统上必须装设压力控制阀，以保证系统的安全。
3、温度范围的调节 复叠式制冷循环的制冷温度是可以调节的，但有一定的温度范围。因压力比不能太大，所以吸气压力不能调节得太低，这就决定了它的下限温度不能太低。同时，吸气压力也不能调得太高，因为随着吸气压力的升高，蒸发温度也升高，当蒸发温度高到一定程度时，就失去了复叠式循环的意义。而且随着吸气压力的升高，冷凝压力也升高，一般压缩机的耐压为2MPa。为使压缩机和制冷系统能正常工作，复盛式制冷循环的蒸发温度在调节时一般不高于-50℃，也不应低于-80℃。
