制冷机组在运转过程中，风侧及水侧换热器会因为灰尘、油污、水垢、杂质等污染而降低传热效果，引起功耗增加甚至机组损坏。修理或安装机组需要管道焊接时，由于氧化作用会使系统内存在氧化物与杂质，这些污物或堵塞过滤器，或进入压缩机损坏机器。因此，有必要对系统进行除污与除垢操作，以保证机组的正常运行。
管路内壁除污常用的方法有高压气体吹除和溶液清洗，有时两者并用。
吹除常用压缩空气或氮气，小型机组有时也用临沂制冷剂进行吹除。吹除清污一般分段进行，先吹高压系统，再吹低压系统，排污口一般设在系统中设备的最低位置以利于污物的排出。吹除的效果可用下列方法进行检验:用一干净的白纱布放置在排污口处，若白纱布上没有污染的痕迹，证明系统已经吹除干净，可以结束吹除工作。
铜管的清洗先用15%~20%的氢氟酸溶液腐蚀3min,除掉弯管内剩余的沙子，再用10%~15%的苏打水溶液和热水冲洗，最后在120~150℃温度下烘干3~4h。毛细管的清洗先用650℃左右的高温烤去管内油污，待冷却后用高压气体吹净灰尘，再用四氯化碳冲洗，用氮气或干燥空气吹干。
