向蒸发器供液。根据库房的热负荷情况，适当开启调节站有关供液膨胀阀，向蒸发器供液，并根据库房的温度适当调节。如果系统采用氨泵供液，则应按照氨泵的操作规程起动氨泵。
调整中间压力。中间压力取决于低压级压缩机的排气量、中间冷却器的蒸发量和高压级压缩机的吸气量。中间压力应与蒸发压力和冷凝压力相适应，当高、低压级制冷压缩机的容积比为1:2时，中间压力为0.25~0. 35MPa;当容积比为1:3时，中间压力应控制在0.35~0. 4MPa，最高不得超过0. 4MPa。在实际运行调节中，应尽可能接近最佳中间压力，使运行的制冷系数最大、能耗最少。
在操作中，一般可以通过调整低压级压缩机的排气量、增减压缩机运转台数的方法，来调整中间压力。例如，当蒸发温度过高，尤其是停机后初开机器时，将会使中间压力过高。此时，应关小低压级压缩机吸气阀或减少能量调节阀挡数，减少排气量，以降低中间压力。
运行调控。双级氨制冷压缩机组运行调控的工作内容，同单级机运行调控的工作内容相似，但具体的参数有所不同。此外，要格外注意对中间压力及机组吸、排气温度的监控，以防止湿行程的发生。
例如，在运行中，如果低压级压缩机的吸、排气温度急剧降低，应先关小低压级压缩机的吸气阀，再关小调节站的有关供液膨胀阀。如果高压级压缩机的吸、排气温度急剧降低，应先关闭中间冷却器供液阀，关小高压级压缩机吸气阀，再关小低压级压缩机吸气阀。
