目前冻干机中使用的加热方式有如下几种。
①搁板接触供热：溶液类制品冻结后形成的冰块导热性能好，采用搁板，玻璃瓶壁到制品的接触供热效果好；搁板用循环介质间接加热，其板温均匀，所以广泛用于医药冻干机和溶液类食品冻干机。
②加热板辐射供热：固态食品切分后分装于托盘中是一种松散堆砌物，在真空下其导热性能差，所以常用辐射加热。
此外也有用空气对流供热（多歧管式冻干机）或灯泡辐射加热
（小型标本冻干机）的。
排除干燥所产生的水蒸气、维持低压真空的方法有如下几种。
①化学方法：用P2O5、无水氯化钙等吸附水蒸气。
②物理方法：
a.用低温冷凝水蒸气十真空泵抽除在该温度下不能凝结的气体，这是目前绝大部分生产用冻干机中使用的方法。
b.用多级喷射泵直接将水蒸气和不能凝结的气体抽出，排至环境中。
