保护剂的配方对于不同的产品，有各自不同的保护剂配方，其配方组成应根据试验确定。保护剂配方组分中一般应包括冻干和储存时的保护剂，形成团块的胶体，羰基中和剂和干燥缓冲剂。质量分数低于4%的溶液还要加填充剂。如果升华时搁板温度始终在0℃以下，则可以不加干燥缓冲剂。
冻干溶液的配方应注意使溶液浓度适当。一般质量分数在4%~25%之间。而且认为最佳质量分数为10%~15%，对于糖类则为5%~10%。质量分数太高会使干燥发生困难。保护剂的选择还应考虑崩解温度（表13）不能太低，否则干燥温度低，干燥时间长，甚至是设备能力所无法达到的。不同配方的保护剂，对干后产品残余水分含量也有一定影响。
对于某种活性物质确定一个通用的配方是困难的，应根据预先检验活性物质与保护剂混合的试验结果来选择保护剂。每个实验室都有自己的配方。作为实例举几例如下。
冻干活菌菌苗所用的保护剂如表3-2所示，冻干活毒用保护剂如表33所示。
