安全保护装置为了人员、设备、产品的安全，冻干机应设置严密可靠的安全保护装置。
系统安全保护
①超压保护。冻干箱、冷阱等是压力容器。蒸气灭菌时，压力超过设定值时报警，自动关闭进蒸气阀：压力超过安全阀调定值时，报警并打开安全阀泄压。
②门上装设限制开关，在门开启时液压压塞系统不能启动。
③门不完全锁闭保护。门未完全锁闭时，进蒸气阀打不开，
安全阀处于开启状态。只有门锁闭到位时，进蒸气阀才能打开，安全阀亦处于关闭状态，
④冻干箱内压力高于大气压，箱门锁闭装置不能开锁，只有箱内压力全部释放，锁才能打开。
⑤所有与操作人员接近的供电都是低压电，所有机器外缘的运动件都配有防护罩。
