正常运转中维护的目的是，保证设备安全运转，延长设备的使用寿命：保证设备发挥最好的运行效果：满足用户的使用要求。
维护的主要内容如下。
①经常注意冻干机的冻干过程中实测的冻干曲线是否与设定的冻干曲线吻合。
②保持压缩机、真空泵组、溶液泵，液压泵、水环泵、冷却水泵等的摩擦部件有良好的润滑条件。保持压缩机曲轴箱、油封真空泵有足够的油位和压缩机油泵有足够的油压。保持油的洁净。回油装置的回油状况良好。
③注意各设备的轴承温度和运转电流，监听其运转声音，检查压缩机的结霜情况和制冷剂视液镜中有无气泡出现。
④检查溶液进、出搁板的温差。
⑤经常检查各监测仪表和控制系统的工作状态。
⑥经常保持设备处于清洁状态，特别是控制室的清洁，还应保持其适当的温度和相对湿度，以保证计算机等控制设备运行正常。
⑦注意各系统的焊缝、法兰、螺纹连接处是否有工质（制冷剂、加热油、液压油）和空气（真空系统）泄漏。
虽然现代医药冻干机均是计算机自动控制、并自动记录和存储冻千工艺参数的。但操作人员还应按时（如每隔1一2h）记录其中的主要工艺参数（冻干箱溶液进出口温度、真空度、拎阱的温度和真空度），压缩机、溶液泵的主要运行参数（如压缩机的吸、排气压力，温度，油压差，制冷剂液体温度，冷却水进、出口温度，溶液泵进、出口压力等），为以后运转、维修和故障处理提供可靠的分析依据。
