冷链物流组织运营的基本内容包括：冷链物流需求预测、设施选址、冷链物流中心设施及设备管理、冷链物流中心运输管理、客户服务及订单管理、冷链物流中心库存控制、冷链物流信息管理、冷链物流成本控制、冷链物流质量控制等。
一、冷链物流需求预测
冷链物流需求预测是指冷链物流企业根据上一季度数据或市场调查进行预测，准确及时地了解目标客户对于物流的具体要求，使企业能够调整资源分配，努力促进这一目标的实现，从而提高客户满意度和公司核心竞争力。
二、设施选址
优化路径是经济学中经常提到的概念，一个战略性选址能帮助企业降低成本，提高服务质量，提升物流效率。合理的设施位置还能缩短生鲜食品从产地到零售商，再到消费者手中的配送时间，降低物流成本。
三、冷链物流中心设施及设备管理
冷链物流中心设施及设备是冷链物流系统的物质基础和条件，直接影响冷链物流服务的质量和成本。冷链物流中心设施及设备管理包括冷链物流设施的规模、中心平面图布置、设备类型选择、单元负载的选择、设备的指派等。
四、冷链物流中心运输管理
如今冷链物流不被大范围推广的很大原因在于其运输成本太高。首先是运输的车辆要经过一系列的改装，并非传统运输车就可以做到的；其次是对于运输人员的要求也较高，必须保证时效性，运输的产品才不会变质，较快捷便利的方式是空运，但成本高。
五、冷链物流中心组织管理
一个良好的管理制度才能发挥这个组织最大的效率，对于冷链物流系统人力资源的管理是建立合理化的冷链物流系统并使它有效运营的根本。冷链物流中心组织管理决策包括企业的管理架构设计、工作设计、劳动定额、定员编制等。
六、客户服务和订单管理
不论是客户服务还是订单管理，都应体现“以客户为中心”的管理思想，保证满足客户的一切合理要求，维护稳定的客户关系，提升整个企业的竞争力。
七、冷链物流中心库存管理
库存管理是指物流过程中商品数量的管理，是生产向消费的过渡阶段。生产向消费过渡的时间间隔越长，库存积压越多，从而导致占用资金，增加负担，而库存过少，又会造成供不应求，丧失市场机会，所以，对于库存要加以合理化控制。库存管理包括：储藏设施的选择是自有还是租赁，储藏设施的布局和设计，产品组合的考虑，安全和服务流程，人员培训及生产率测算等。
八、冷链物流信息管理
冷链物流信息系统，是通过对企业冷链物流相关的信息进行收集、传输、加工处理来实现对冷链物流的有效管制和管理，并为冷链物流管理人员提供战略及运营决策支持的人机系统。冷链物流信息系统是提高冷链物流运营效率、降低冷链物流总成本和实现冷链物流信息化管理的重要基础设施。
九、冷链物流成本控制
冷链物流成本控制是指企业根据一段时期内预定的目标，在其目标完成的过程中对影响成本的一系列因素进行预防和调节，以保证目标完成和成本最小化。这也是冷链物流经济效益的量化指标。冷链物流成本控制涵盖以下几个方面：冷链物流成本的计划与预算，冷链物流成本核算，冷链物流劳动定额，冷链物流考核指标和方法，冷链物流成本控制措施等。
十、冷链物流质量控制
质量控制是为了达到质量要求而采取的一系列技术活动。决定冷链物流质量的因素是多方面的，包括商品质量、服务质量、工作质量、工程质量等。在冷链物流中，我们着重强调冷链物流商品质量，即在冷链商品流通过程中必须注意冷链物流作业的速度和质量以及温度控制，将易腐的生鲜食品从产地收购、加工、储藏、运输、销售直到消费的各个环节都置于适当的低温环境中，以保证食品的质量，减少食品的损耗，防止食品的变质和污染。
