冷链物流系统设计需要着重评价以下三个方面：
（一）技术性能评价
冷链物流系统设计的技术性能评价，需要考虑冷链系统的具体指标。例如，冷链网络性能评价，主要关注冷链物流网络的总体建设水平、布局与规划、容量与规模等方面；冷链物流节点性能评价，主要关注冷藏仓库、配送中心和物流中心的数量、布局、容量和发展空间等：就单个冷藏仓库而言，主要关注订货量、客户服务水平、利用率、仓储容量等。
（二）经济性评价
经济性评价主要关注冷链物流系统对资源的消耗和系统的产出效益。冷链物流系统的消耗费用计算，是指用于规划项目建设、管理和运营所付出的经济代价，即所有投入的物质资源和人力资源，一般可用货币形式计量。而冷链物流系统建设的经济效益，是指由于冷链系统的建设而产生的订单增加和经济增值，表现为有冷链系统规划相对于无物流系统时，总费用的节约及其效益增值。当然，由于冷链系统的规划与设计投资巨大，因此需要在一定的年限内才能弥补巨额投资所带来的成本。
（三）社会环境影响评价
评价一个冷链系统的好坏，除了可度量的经济效益外，还需要考虑它的社会环境影响。同时，也包括其潜在的经济影响，在一定程度上可能引起的社会环境及自然环境的变化，包括有利的影响和不利的影响。因此，在评价一个冷链系统规划与设计方案时，也会从系统的、可持续发展的角度来考虑。
